Çankaya Üniversitesi Matematik Bölümünün amacı, öğrencilere matematik alanında modern bir eğitim verirken aynı zamanda bilgisayar bilimi ve diğer ilgili alanlarda da temel eğitim sağlamaktır. Böylece, bilim ve sanayi için gerekli modern bilgilere sahip iş gücünü üretmek hedeflenmektedir.