Çankaya Üniversitesi Lisansüstü Eğitim ve Öğretim Yönetmeliği Md. 14'da belirtildiği gibi, lisansüstü programlar arası geçişler ve ders saydırma, Enstitü Ana Bilim Dalı Başkanı'nın önerisi üzerine, ilgili enstitü kurulu tarafından belirlenir.